DNK stega
DNK stega, poznata i kao klizeća stega, je proteinska struktura koja služi kao faktor progresije DNK replikacije. Ona je kritična komponenta DNK polimeraze III. Klamfa se vezuje za DNK polimerazu i sprečava disocijaciju tog enzima sa templata DNK lanca. Protein–protein interakcije između stege i proteaze su jače i specifičnije nego direktne interakcije između polimeraze i templeta, DNK lanca. Jedan od korak koji ogračava brzinu reakcije DNK sinteze je vezivanje polimeraze sa DNK templetom, te prisustvo klizeće stege dramatično povećava broj nukleotida koje polimeraza može da doda u rastući lanac tokom pojedinačnog vezivanja. Prisustvo DNK stege može da povisi brzinu DNK sinteze oko 1.000 puta.[2]
Reference
- ^ PDB: 1W60; Kontopidis G, Wu SY, Zheleva DI, Taylor P, McInnes C, Lane DP, Fischer PM, Walkinshaw MD (2005). „Structural and biochemical studies of human proliferating cell nuclear antigen complexes provide a rationale for cyclin association and inhibitor design”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102 (6): 1871—6. PMC 548533
. PMID 15681588. doi:10.1073/pnas.0406540102. - ^ V. Mizrahi; R. N. Henrie; J. F. Marlier; K. A. Johnson; S. J. Benkovic (1985). „Rate-limiting steps in the DNA polymerase I reaction pathway”. Biochemistry. 24 (15): 4010—4018. doi:10.1021/bi00336a031.
Literatura
- Clamping down on pathogenic bacteria Архивирано 2013-08-02 на сајту Archive.today – how to shut down a key DNA polymerase complex. Quips at PDBe
- Watson JD, Baker TA, Bell SP, Gann A, Levine M, Losick R (2004). Molecular Biology of the Gene. San Francisco: Pearson/Benjamin Cummings.
Spoljašnje veze
- SCOP - DNK stega
- clamp+protein+DnaN,+E+coli на US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
- p
- r
- u
i inicijacija
| Prokariotska (inicijacija) | |
|---|---|
| Eukariotska (priprema u G1 fazi) | Prereplikacioni kompleks: Kompleks prepoznavanja mesta početka (ORC1, ORC2, ORC3, ORC4, ORC5, ORC6) · Održavanje minihromozoma (MCM2 · MCM3 · MCM4 · MCM5 · MCM6 · MCM7) · CDC6 Autonomna replikaciona sekvenca Protein jednolančanog vezivanja (SSBP1, SSBP2, SSBP3, SSBP4) Primaza: PRIM1 · PRIM2 |
| Oba | Početak replikacije/Ori/Replikon Replikaciona viljuška (zaostajući i vodeći lanci) · Okazakijev fragment · Prajmer |
| Prokariotska (elongacija) | DNK polimeraza III holoenzim (dnaC, dnaE, dnaH, dnaN, dnaQ, dnaT, dnaX, holA, holB, holC, holD, holE) · Replizom · DNK ligaza · DNK stega · Topoizomeraza (DNK giraza) Prokariotska DNK polimeraza: DNK polimeraza I (Klenov fragment) |
|---|---|
| Eukariotska (sinteza u S fazi) | Replikacioni faktor C (RFC1) · Endonukleaza prepusta (FEN1) · Topoizomeraza · Replikacioni protein A (RPA1) Eukariotska DNK polimeraza: delta (POLD1, POLD2, POLD3, POLD4) DNK stega (PCNA) |
| Oba | Kretanje: Procesivnost · DNK ligaza |
B bsyn: dnk (repl, cycl, reco, repr) · tscr (fact, tcrg, nucl, rnat, rept, ptts) · tltn (risu, pttl, nexn) · dnab, rnab/runp · stru (domn, 1°, 2°, 3°, 4°)
