Distribució bivariada de von Mises

Infotaula distribució de probabilitatDistribució bivariada de von Mises
Tipusdistribució de probabilitat Modifica el valor a Wikidata
EpònimRichard von Mises Modifica el valor a Wikidata

En teoria i estadística de probabilitats, la distribució bivariada de von Mises és una distribució de probabilitat que descriu valors en un tor. Es pot considerar com un anàleg del to de la distribució normal bivariada.

  • Mostres de la variant cosinus de la distribució bivariada de von Mises. Els punts verds es mostren a partir d'una distribució amb alta concentració i sense correlació ('"`UNIQ--postMath-00000001-QINU`"', '"`UNIQ--postMath-00000002-QINU`"'), els punts blaus es mostren a partir d'una distribució amb alta concentració i correlació negativa ('"`UNIQ--postMath-00000003-QINU`"', '"`UNIQ--postMath-00000004-QINU`"'), i els punts vermells es mostren a partir d'una distribució amb baixa concentració i sense correlació ('"`UNIQ--postMath-00000005-QINU`"')
    Mostres de la variant cosinus de la distribució bivariada de von Mises. Els punts verds es mostren a partir d'una distribució amb alta concentració i sense correlació ( κ 1 = κ 2 = 200 {\displaystyle \kappa _{1}=\kappa _{2}=200} , κ 3 = 0 {\displaystyle \kappa _{3}=0} ), els punts blaus es mostren a partir d'una distribució amb alta concentració i correlació negativa ( κ 1 = κ 2 = 200 {\displaystyle \kappa _{1}=\kappa _{2}=200} , κ 3 = 100 {\displaystyle \kappa _{3}=100} ), i els punts vermells es mostren a partir d'una distribució amb baixa concentració i sense correlació ( κ 1 = κ 2 = 20 , κ 3 = 0 {\displaystyle \kappa _{1}=\kappa _{2}=20,\kappa _{3}=0} )

La distribució pertany al camp de l'estadística direccional. La distribució bivariada general de von Mises va ser proposada per primera vegada per Kanti Mardia el 1975.[1][2] Una de les seves variants s'utilitza avui en el camp de la bioinformàtica per formular un model probabilístic d'estructura de proteïnes en detall atòmic,[3][4] com les biblioteques de rotamers dependents de la columna vertebral.

Definició

La distribució bivariada de von Mises és una distribució de probabilitat definida en el torus, S 1 × S 1 {\displaystyle S^{1}\times S^{1}} en R 3 {\displaystyle \mathbb {R} ^{3}} . La funció de densitat de probabilitat de la distribució bivariada general de von Mises per als angles ϕ , ψ [ 0 , 2 π ] {\displaystyle \phi ,\psi \in [0,2\pi ]} ve donada per [5]

f ( ϕ , ψ ) exp [ κ 1 cos ( ϕ μ ) + κ 2 cos ( ψ ν ) + ( cos ( ϕ μ ) , sin ( ϕ μ ) ) A ( cos ( ψ ν ) , sin ( ψ ν ) ) T ] , {\displaystyle f(\phi ,\psi )\propto \exp[\kappa _{1}\cos(\phi -\mu )+\kappa _{2}\cos(\psi -\nu )+(\cos(\phi -\mu ),\sin(\phi -\mu ))\mathbf {A} (\cos(\psi -\nu ),\sin(\psi -\nu ))^{T}],}

on μ {\displaystyle \mu } i ν {\displaystyle \nu } són els mitjans per ϕ {\displaystyle \phi } i ψ {\displaystyle \psi } , κ 1 {\displaystyle \kappa _{1}} i κ 2 {\displaystyle \kappa _{2}} la seva concentració i la matriu A M ( 2 , 2 ) {\displaystyle \mathbf {A} \in \mathbb {M} (2,2)} està relacionada amb la seva correlació.

Dues variants d'ús habitual de la distribució bivariada de von Mises són la variant sinus i cosinus. La variant del cosinus de la distribució bivariada de von Mises [6] té la funció de densitat de probabilitat

f ( ϕ , ψ ) = Z c ( κ 1 , κ 2 , κ 3 )   exp [ κ 1 cos ( ϕ μ ) + κ 2 cos ( ψ ν ) κ 3 cos ( ϕ μ ψ + ν ) ] , {\displaystyle f(\phi ,\psi )=Z_{c}(\kappa _{1},\kappa _{2},\kappa _{3})\ \exp[\kappa _{1}\cos(\phi -\mu )+\kappa _{2}\cos(\psi -\nu )-\kappa _{3}\cos(\phi -\mu -\psi +\nu )],}

on μ {\displaystyle \mu } i ν {\displaystyle \nu } són els mitjans per ϕ {\displaystyle \phi } i ψ {\displaystyle \psi } , κ 1 {\displaystyle \kappa _{1}} i κ 2 {\displaystyle \kappa _{2}} la seva concentració i κ 3 {\displaystyle \kappa _{3}} està relacionada amb la seva correlació. Z c {\displaystyle Z_{c}} és la constant de normalització. Aquesta distribució amb κ 3 {\displaystyle \kappa _{3}} =0 s'ha utilitzat per a les estimacions de la densitat del nucli de la distribució dels angles dièdrics de proteïnes ϕ {\displaystyle \phi } i ψ {\displaystyle \psi } .

La variant sinus té la funció de densitat de probabilitat [7]

f ( ϕ , ψ ) = Z s ( κ 1 , κ 2 , κ 3 )   exp [ κ 1 cos ( ϕ μ ) + κ 2 cos ( ψ ν ) + κ 3 sin ( ϕ μ ) sin ( ψ ν ) ] , {\displaystyle f(\phi ,\psi )=Z_{s}(\kappa _{1},\kappa _{2},\kappa _{3})\ \exp[\kappa _{1}\cos(\phi -\mu )+\kappa _{2}\cos(\psi -\nu )+\kappa _{3}\sin(\phi -\mu )\sin(\psi -\nu )],}

on els paràmetres tenen la mateixa interpretació.

Referències

  1. Mardia, Kanti «"Statistics of directional data"». J. R. Stat. Soc. B, 37, 3, 1975, pàg. 349–393. JSTOR: 2984782.
  2. Mardia, K. V.. «Statistics of Bivariate von Mises Distributions». A: Bayesian Methods in Structural Bioinformatics (en anglès), 2012, p. 159 (Statistics for Biology and Health). DOI 10.1007/978-3-642-27225-7_6. ISBN 978-3-642-27224-0. 
  3. Boomsma, W.; Mardia, K. V.; Taylor, C. C.; Ferkinghoff-Borg, J.; Krogh, A. «"A generative, probabilistic model of local protein structure"». Proceedings of the National Academy of Sciences, 105, 26, 2008, pàg. 8932–7. Bibcode: 2008PNAS..105.8932B. DOI: 10.1073/pnas.0801715105. PMC: 2440424. PMID: 18579771 [Consulta: free].
  4. Shapovalov MV, Dunbrack, RL «"A smoothed backbone-dependent rotamer library for proteins derived from adaptive kernel density estimates and regressions"». Structure, 19, 6, 2011, pàg. 844–858. DOI: 10.1016/j.str.2011.03.019. PMC: 3118414. PMID: 21645855.
  5. Mardia, Kanti «"Probabilistic model for two dependent circular variables"». J. R. Stat. Soc. B, 37, 3, 1975, pàg. 349–393. JSTOR: 2984782.
  6. Boomsma, W.; Mardia, K. V.; Taylor, C. C.; Ferkinghoff-Borg, J.; Krogh, A. Proceedings of the National Academy of Sciences, 105, 26, 2008, pàg. 8932–7. Bibcode: 2008PNAS..105.8932B. DOI: 10.1073/pnas.0801715105. PMC: 2440424. PMID: 18579771 [Consulta: lliure].
  7. Singh, H. Biometrika, 89, 3, 2002, pàg. 719–723. DOI: 10.1093/biomet/89.3.719.
  • Vegeu aquesta plantilla
Distribucions discretes
amb suport finit
Distribucions discretes
amb suport infinit
Distribucions contínues
suportades sobre un interval acotat
Distribucions contínues
suportades sobre un interval semi-infinit
Distribucions contínues
suportades en tota la recta real
Distribucions contínues
amb el suport de varis tipus
Barreja de distribució variable-contínua
Distribució conjunta
Discreta
Ewens
Multinomial
Multinomial de Dirichlet
Multinomial negativa
Contínua
Dirichlet
Dirichlet generalitzada
Estable multivariant
Gamma normal
Gamma normal inversa
Normal multivariable
t multivariable
Matriu de valor
Matriu gamma
Matriu gamma inversa
Matriu normal
Normal de Wishart
Normal de Wishart inversa
t matriu
Wishart
Wishart inversa
Direccionals
Univariada (circular)
Asimètrica de Laplace envoltada
Cauchy envoltada
Exponencial envoltada
Lévy envoltada
Normal envoltada
Circular uniforme
Univariada de von Mises
Bivariada (esfèrica)
Kent
Bivariada (toroidal)
Bivariada de von Mises
Multivariada
von Mises-Fisher
Bingham
Degenerada i singular
Degenerada
Delta de Dirac
Singular
Cantor
Famílies