KCNT2

Ідентифікатори

Символи

KCNT2, KCa4.2, SLICK, SLO2.1, potassium sodium-activated channel subfamily T member 2, EIEE57, DEE57

Зовнішні ІД

OMIM: 610044 MGI: 3036273 HomoloGene: 16121 GeneCards: KCNT2

Пов'язані генетичні захворювання

early infantile epileptic encephalopathy 57^[1]

Реагує на сполуку

niflumic acid, tetraethylammonium^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• voltage-gated potassium channel activity • ATP binding • nucleotide binding • potassium channel activity • calcium-activated potassium channel activity • intracellular sodium activated potassium channel activity • outward rectifier potassium channel activity • chloride-activated potassium channel activity
Клітинна компонента	• voltage-gated potassium channel complex • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана
Біологічний процес	• potassium ion transmembrane transport • potassium ion transport • ion transport • regulation of membrane potential • potassium ion export across plasma membrane
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


343450


240776

Ensembl


ENSG00000162687


ENSMUSG00000052726

UniProt


Q6UVM3


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_001287819 NM_001287820 NM_198503


NM_001081027

RefSeq (білок)


NP_001274748 NP_001274749 NP_940905


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 1: 196.23 – 196.61 Mb

Хр. 1: 140.17 – 140.54 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KCNT2 (англ. Potassium sodium-activated channel subfamily T member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 135 амінокислот, а молекулярна маса — 130 501^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVDLESEVPP	LPPRYRFRDL	LLGDQGWQND	DRVQVEFYMN	ENTFKERLKL
FFIKNQRSSL	RIRLFNFSLK	LLSCLLYIIR	VLLENPSQGN	EWSHIFWVNR
SLPLWGLQVS	VALISLFETI	LLGYLSYKGN	IWEQILRIPF	ILEIINAVPF
IISIFWPSLR	NLFVPVFLNC	WLAKHALENM	INDLHRAIQR	TQSAMFNQVL
ILISTLLCLI	FTCICGIQHL	ERIGKKLNLF	DSLYFCIVTF	STVGFGDVTP
ETWSSKLFVV	AMICVALVVL	PIQFEQLAYL	WMERQKSGGN	YSRHRAQTEK
HVVLCVSSLK	IDLLMDFLNE	FYAHPRLQDY	YVVILCPTEM	DVQVRRVLQI
PMWSQRVIYL	QGSALKDQDL	LRAKMDDAEA	CFILSSRCEV	DRTSSDHQTI
LRAWAVKDFA	PNCPLYVQIL	KPENKFHIKF	ADHVVCEEEF	KYAMLALNCI
CPATSTLITL	LVHTSRGQEG	QQSPEQWQKM	YGRCSGNEVY	HIVLEESTFF
AEYEGKSFTY	ASFHAHKKFG	VCLIGVRRED	NKNILLNPGP	RYIMNSTDIC
FYINITKEEN	SAFKNQDQQR	KSNVSRSFYH	GPSRLPVHSI	IASMGTVAID
LQDTSCRSAS	GPTLSLPTEG	SKEIRRPSIA	PVLEVADTSS	IQTCDLLSDQ
SEDETTPDEE	MSSNLEYAKG	YPPYSPYIGS	SPTFCHLLHE	KVPFCCLRLD
KSCQHNYYED	AKAYGFKNKL	IIVAAETAGN	GLYNFIVPLR	AYYRPKKELN
PIVLLLDNPP	DMHFLDAICW	FPMVYYMVGS	IDNLDDLLRC	GVTFAANMVV
VDKESTMSAE	EDYMADAKTI	VNVQTLFRLF	SSLSIITELT	HPANMRFMQF
RAKDCYSLAL	SKLEKKERER	GSNLAFMFRL	PFAAGRVFSI	SMLDTLLYQS
FVKDYMISIT	RLLLGLDTTP	GSGFLCSMKI	TADDLWIRTY	ARLYQKLCSS
TGDVPIGIYR	TESQKLTTSE	SQISISVEEW	EDTKDSKEQG	HHRSNHRNST
SSDQSDHPLL	RRKSMQWARR	LSRKGPKHSG	KTAEKITQQR	LNLYRRSERQ
ELAELVKNRM	KHLGLSTVGY	DEMNDHQSTL	SYILINPSPD	TRIELNDVVY
LIRPDPLAYL	PNSEPSRRNS	ICNVTGQDSR	EETQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, калію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з KCNT2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium sodium-activated channel subfamily T member 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18866 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q6UVM3 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані